مرکز تحقیقات مهندسی فارس وابسته به پژوهشکده مهندسی در سال 1365 در شيراز تاسيس گرديد. اين پژوهشکده با انجام پروژههای مشاوره، طراحی، تدوين فناوري و اجرای واحدهای صنعتی در صنایع غذایی، شیمیایی، صنايع تبديلي و زيست فناوري در كشور به كار خود توسعه بخشید. در حال حاضر اين پژوهشکده با برخورداري از امكانات آزمايشگاهي، كارگاه هاي ساخت و مونتاژ، كارگاه هاي پايلوت و با بهرهمندي از توان كارشناسان و متخصصان توانمند خود، موفق به اجراي بيش از يكصد طرح بزرگ تحقيقاتي و صنعتي در زمينه هاي مختلف شده است، دستاورد اين تلاش ها دريافت جايزه «سازنده برتر تجهيزات صنايع شير»، كسب رتبه هاي برتر در جشنواره خوارزمي و حضور درخشان در ساير عرصه هاي علمي و صنعتي بوده است.
برخی از مهمترین فعالیت ها و زمینههای کاری مرکز